Nun ergeben sich dadurch einige wichtige offene Fragen:
- Wie sind die Hauptcharaktere nach City 17 gelangt? Die Combines nutzen das Schienennetz sehr ausgiebig, ständig fahren irgendwelche Lastenzüge von A nach B. Im Bahnhof von City 17, wo Gordon zu Beginn von Half-Life 2 ankommt, sieht man, dass es zu mehreren Städten auch einen zivilen Zugverkehr gibt. Jedoch ist auszuschließen, dass die genannten Städte sich all zu weit von City 17 aufhalten. Es macht also wenig Sinn, dass sich z.B. City 8 in der Nähe von Tokio in Japan befindet, wie es eine Fan-Mod vermutet hat, da es für die Arbeiter keinen Grund gibt den weiten Weg zu einer anderen Stadt aufzunehmen - Urlaub wird wohl nicht erlaubt sein. Man kann also zu dem Schluss kommen, dass die Menschen in einem kleinen System von Städten gefangen sind und nur die Combines die Mittel haben, um große Menschenmassen über weite Strecken zu transportieren.
Wie hat es die Hauptcharaktere also nach Europa verschlagen? Sind sie freiwillig dort, weil die Combines dort ihre zentrale Verwaltungsstation haben oder wurden sie dorthin deportiert? Wenn sie freiwillig dort sind: Wie haben sie es geschafft dort hinzukommen? - Wieso lassen die Combines zu, dass all die Forscher und ehemaligen Black Mesa Mitarbeiter, die zusammen eine gewisse potenzielle Gefahr darstellen, sich an einem Ort aufhalten? Isaac Kleiner, Eli und Alyx Vance, Judith Mossman, Arne Magnusson, Barney Calhoun und natürlich auch Wallace Breen.
Wäre es für die Combines nicht vorteilhafter, wenn man diese Personen nicht besser voneinander getrennt hätte, damit sie nicht ihre Erfahrungen und Kompetenzen gebündelt zum Widerstand nutzen können?