Oder es war vorher einfach kein lohnendes Ziel, da der Rebellenführer sich in Black Mesa East aufhielt und man vorher den Plan hegte, den Wiederstand nicht zu zerschlagen, sondern einfach erzwingen wollte, dass die Rebellen von selbst aufgeben. Dazu wurde auch Eli festgenommen, nachdem Gordon so elegant wie er immer agiert, die Combine genau zu dem Ort führte, wo er sich versteckt. Gut wäre früher oder später eh passiert, aber sein Auftreten und der Unfall mit dem Teleporter führten dazu, dass genau in dem Moment gehandelt werden musste seitens der Combine, warum konnte man ja sehen. (Was meiner Ansicht genau das ist was der GMan erzwingen wollte, nämlich dass sich mit Gordon plötzlich alles verändert.)
Als dann City 17 aber im Kampf unterging und von der Explosion der Zitatdelle geebnet wurde, sahen die Combine keine weitere Chance, als den Widerstand ein für alle Mal zu zerschlagen, zumal Alyx und "Ich-überhaupt-nicht-auffällig-aber-drücke-ich-einen-Knopf-explodiert-alles-Gordon" ja mit dem gestohlenen Daten wieder fast alle Augen auf sich haben blicken lassen. Darum nahmen sie auch einen anderen Zug. Was im Endeffekt aber nur kurzweilig etwas gebracht hat, da nach der Zerstörung von City 17, sich eh die Combine daran gemacht haben White Forest aufzusuchen. Denke mal, dass bekannt war, dass White Forest der nächstbeste Anlaufpunkt für die Rebellen ist, ergo würde ich meine Armee auch dahin schicken.