Die Citadelle in City 17 ist die Hauptzitadelle der ganzen Welt in der auch der Weltadministrator Dr. Breen stellvertretend für die Combine regiert bzw. regierte. Natürlich wird es in anderen städten auch noch Zitadellen geben aber nicht wie in dem Ausmaß in City 17.
Der ganze Hintergrund in EP1 und EP2 ist ja, dass die Combine durch diese explosion des Zitadellenkerns ein riesen Portal öffnen wollen damit sie anscheinend mehr Schiffe/Soldaten usw. auf die Erde schaffen können. Es scheint eben so als wären die Combine nicht in der Lage größere Portale zu erschaffen, deswegen wird es dann später in EP3 bzw. Half Life 3 wahrscheinlich um die Borealis gehen in der eine mächtige Waffe sein soll oder bzw. ein sehr mächtiges Portal? Gerade ein mächtiges Portal macht wegen der Story in dem Spiel Portal sinn, dort ging es hauptsächlich ja auch um Portale.