Das Aufnehmen findet im Hintergrund statt und verbraucht viel Ressourcen. Das muss sich dann nicht gleichbedeutend auf die FPS-Anzeige in deinem CS auswirken und kann trotzdem ruckeln.
Vielleicht probierst du es mal mit einem anderen Aufnahmeprogramm oder stellst die Aufnahmequalität etwas herunter.