Ich würde sagen, dass Portal 2 mehr über Aperture Science und ihrem Verhältnis zu Black Mesa erzählen wird.
Vielleicht erzählt es sogar, wie die Borealis verschwunden ist.
Noch eine Option: Es erzählt die Parallelgeschichte zu Half Life 1, und zeigt aus der Sicht von AS die Geschehnisse die in Black Mesa geschehen.
Natürlich jede der Möglchkeiten mit Cave Johnson verknüpft