Ich glaube nicht dass man an dem Hitbox-Code viel ändern kann. Der "Netcode" ist Teil der Engine und den Engine-Sourcecode bekommt man mit dem SDK nicht. Der Hitbox-Code dürfte Teil des Netcodes sein. Falls ich mich irre belehrt mich eines besseren.
Ich empfehle dir, dich einfach mal durch die Datei-Struktur des Source SDK zu arbeiten. Dann findest du (sofern du dich schonmal mit Mapping & Entities beschäftigt hast) recht schnell einen Überblick.